CIFOR-ICRAF trabaja en Brasil desde 2004, forjando asociaciones estratégicas destinadas al desarrollo de conocimientos científicos sobre los bosques, el uso sostenible de la tierra y soluciones agroforestales adaptadas a diferentes contextos.

La investigación se ha centrado en la restauración del paisaje forestal, los sistemas, y la mitigación del cambio climático y la adaptación a este, principalmente en los biomas de la Amazonia, el Cerrado y la Mata Atlántica. Otras áreas de investigación son: REDD+, las cuestiones de género, la promoción de sistemas agroforestales, los procesos de aprendizaje conjunto para la inclusión de la agroforestería con cultivos clave, el codiseño de sistemas agroforestales, los árboles en fincas para favorecer la biodiversidad, y los sistemas agroforestales biodiversos y sucesionales.